AniRA - AGC - Analyse Génétique et Cellulaire - Old
Présentation
Le plateau AniRA-AGC (Analyse Génétique et Cellulaire) est divisé en 3 services :
- le service AniRA Analyse Génétique,
- le service AniRA Génotypage,
- le service AniRA CRB CelluloNet
Le service AniRA Analyse Génétique a pour mission d’accompagner les scientifiques dans le développement de projets utilisant les techniques de PCR Quantitative. La PCR en temps réel est un outil puissant et incontournable pour la quantification des acides nucléiques. Cette méthode rapide, sensible et reproductible couvre une large variété d’applications comme l’étude de l’expression de gènes, des miRNA mais également le génotypage de SNP (discrimination allélique) ou bien la variation du nombre de copies (CNV). Cette technique est également utilisée pour la détection et la quantification de microorganismes ou encore la caractérisation de mutations connues ou inconnues par courbe de fusion haute résolution (HRM ou High Resolution Melting).
Le service AniRA Génotypage (certifié ISO 9001 : 2015) en lien avec le Plateau de Biologie Expérimentale de la Souris (AniRA-PBES) assure le génotypage par PCR des souris transgéniques. Très largement utilisé par les membres de l’UMS 3444-US8, ce service gère un grand nombre d’analyses représentant plus 20 000 PCR par an.
Le service AniRA CelluloNet est un Centre de Ressources Biologiques (CRB) de lignées cellulaires qui propose une sauvegarde et une mise à disposition de lignées cellulaires. La collection compte actuellement plus de 550 lignées cellulaires, parfois uniques, constituant des modèles et des outils d’étude précieux que les chercheurs utilisent et valorisent. Les activités du CRB CelluloNet sont décrites ici.
AniRA-Analyse génétique et cellulaire est intégré dans la plateforme régionale AniRA labélisée IBiSA, membre de l’Infrastructure de Recherche nationale Celphedia.
Citation de la SFR Biosciences sur les publications
Activités
Le plateau AniRA-Analyse génétique offre plusieurs services :
La plateforme gère et met à disposition une instrumentation scientifique de qualité, adaptée aux exigences de cette technologie.
Ces instruments forment un tout cohérent afin de permettre :
- La quantification et le contrôle des acides nucléiques (Nanodrop, Dropsens, Bioanalyseur).
- La préparation robotisée des plaques 96 puits QPCR (robots Tecan Qiagen) et les circuits QPCR.
- Le dessin des amorces et l’analyse des résultats par des logiciels adaptés.
Veille et développements technologiques :
- La QPCR est une technologie en constante évolution : la plateforme assure une veille technologique et propose régulièrement des séminaires présentant les innovations les plus marquantes.
Conseils/expertise :
- Le plateau apporte son aide pour la mise en place de projets, l’interprétation des résultats ou l’adaptation d’une technologie à un contexte particulier.
Prestations :
- Réalisation des génotypages PCR pour le suivi des lignées génétiquement modifiées.
- Transfert de technologie : adaptation d'un protocole pour le génotypage d'une nouvelle lignée
équipements
[Site de réservation des équipements]
Les équipements du plateau QPCR sont repartis sur les différents site de l’UMS à proximité des équipes utilisatrices. Ces instruments bénéficient de contrats d’entretien annuels afin d’assurer leur fiabilité et sont sous la responsabilité d’un personnel du site mutualisé pour un bon suivi.
Site tour CERVI :
- Applied Step One Plus, pièce 111 Responsable bariza.blanquier@inserm.fr
- ABI PRISM 7000 SDS, pièce 111 Responsable bariza.blanquier@inserm.fr
- Spectrophotomètre Nanodrop, pièce 204 Responsable cyrille.mathieu@inserm.fr
- Spectrophotomètre Denovix , pièce 204 Responsable cyrille.mathieu@inserm.fr
- Circuit QPCR 1)Hotte ADN P110 2)Hotte MIX P512 Responsable bariza.blanquier@inserm.fr
- Robot Qiagility pièce 110 Responsable bariza.blanquier@inserm.fr
- Poste Bio-informatique bureau 504 Responsable bariza.blanquier@inserm.fr
Site ENS de Lyon : Sous-sol M5 pièces 140 et 136
- Applied Step One Plus Piece 136 Responsable caroline.costa@ens-lyon.fr
- Applied Step One Plus Piece 136 Responsable didier.decimo@ens-lyon.fr
- Rotorgene HRM Piece 140 Responsable cecile.bedet@ens-lyon.fr
- Spectrophotomètre Nanodrop M5 piece 230 Responsable didier.decimo@ens-lyon.fr
- Spectrophotomètre Dropsens Trinean pièce 140 Responsable pierre.chambrier@ens-lyon.fr
- Circuit QPCR ENS 1)Hotte ADN piece 136 Hotte 2)MIX piece 140 Responsables Sophie Blanc et Claudine Corneloup
Site IBCP :
- RotorGene HRM piece 177 Responsable marielle.pasdeloup@ibcp.fr
- Nanodrop 2000 piece 104 Responsable sandrine.legoff@ibcp.fr
Contact/Localisation
Comment accéder aux plateaux - entrée de sites (en intranet)
Les équipements sont répartis sur les différents sites de la SFR, à proximité des unités contributrices. Ils sont accessibles et réservables en ligne après création d’un compte utilisateur et d'une formation.
Pour tout renseignement, contactez :
- Bariza Blanquier: responsable plateau
- Tel : 04 37 28 23 26
- Mail :agc.us8@inserm.fr
Formation
Il est indispensable de bien maitriser les aspects théoriques et techniques de la PCR Quantitative pour pouvoir générer des résultats fiables et reproductibles. La plateforme vous propose plusieurs modules de formation vous permettant d’appréhender et comprendre les différents aspects de la technologie en accord avec les recommandations des MIQE (minimum requis pour la publication d’un papier QPCR) et acquérir ainsi une bonne autonomie dans la gestion de vos projets QPCR.
Tarifs
Tarifs accessibles en intranet (équipes contributrices et équipes académiques) ou sur demande spécifique.
Documentation
Livret conseil détection de mycoplasmes
Liens